激光鐳射對人體的損害主要包括對眼睛和對皮膚的損害。在激光的傷害中，以機體中眼睛的傷害最為嚴重。波長在可見光和近紅外光的激光，眼屈光介質的吸收率較低，透射率高，而屈光介質的聚焦能力（即聚光力）強。強度高的可見或近紅外光進入眼睛時可以透過人眼屈光介質，聚積光于視網膜上。此時視網膜上的激光能量密度及功率密度提高到幾千甚至幾萬倍，大量的光能在瞬間聚中于視網膜上，致視網膜的感光細胞層溫度迅速升高，以至使感光細胞凝固變性壞死而失去感光的作用。激光聚于感光細胞時產生過熱而引起的蛋白質凝固變性是不能可逆的損傷。一旦損傷以后就會造成眼睛的永久失明。激光的波長不同對眼球作用的程度不同，其后果也不同。遠紅外激光對眼睛的損害主要以角膜為主，這是因為這類波長的激光幾乎全部被角膜吸收，所以角膜損傷最重，主要引起角膜炎和結膜炎，患者感到眼睛痛，異物樣刺激、怕光、流眼淚、眼球充血，視力下降等。發生遠紅外光損傷時應遮住保護傷眼，防止感染發生，對癥處理。
人體皮膚由于生理結構有很敏感的觸、疼、溫等功能，構成一個完整的保護層。而且皮膚由多組織層次組成，在每一層中都有不同的細胞。激光照到皮膚時，如其能量（功率）過大時可引起皮膚的損傷，當然損傷灶可以由組織修復，雖然功能有所下降，但不影響整體功能結構，與對眼睛的損傷要輕得多。
因此激光鐳射損傷皮膚的機理主要是由激光的熱作用所致。皮膚吸收激光能量以后，局部的皮膚溫度在短時內升高，溫度升高的程度不同，造成的損害也不同。尤其是紅外激光突出，如CO2激光（汽體激光），皮膚對此類10.6μm波長紅外激光吸收率很高，透過率很低，皮膚對CO2激光產生強烈吸收，使皮膚的局部溫度快速升高，極容易造成損害。 激光損害皮膚的嚴重程度是由皮膚對激光吸收率決定的，皮膚對激光的吸收率由激光的波長所決定。皮膚對某波長激光的吸收率越高，受到的損傷也越嚴重。如皮膚對紫外激光和紅外激光的吸收率很高時，這兩類激光就是損傷皮膚的主要波段激光。紅外激光對皮膚主要作用是熱燒傷，此類激光照射皮膚，功率比較小時而致毛細血管擴張，皮膚發紅發熱。隨著激光功率密度增大，熱損傷程度也隨著增大。相反的是，紫外激光對皮膚的作用主要是光作用。在紫外激光照射皮膚時可以引起皮膚紅斑、老化，過量時嚴重的致癌變。對皮膚危害性最大的紫外光波在270～290nm，波長比270～290nm大的或小的其危害程度都相對地減少。由此可以看出，必須高度重視對激光的防護